Le lac et l'île ont été formés après l'éruption d'un volcan il y a 75000 ans. L'île était au départ reliée au bord du cratère par un isthme, qui a été supprimé pour aider la navigation.
Avec 630 km², Samosir est la plus grande île dans une île, et la cinquième plus grande île dans un lac du monde.
La population qui vit autour du lac Toba sont les Batak du groupe Toba, qui a donné son nom au lac.
Tomok, village traditionnel qui abrite la tombe de Raja Sidabuta (souverain qui régna avant l'introduction du christianisme), de la reine et de la maîtresse du roi.
